研究證實，腸道菌群失調是百病之源，比如便秘、腸炎、潰瘍、糖尿病、肥胖，甚至腫瘤等等，那么哪些因素會導致腸道菌群失調呢？

一、環境因素

前蘇聯時期的愛沙尼亞兒童比瑞典兒童存在更豐富的腸道菌群，這說明環境因素對腸道菌群的數量和種類會產生較大影響。破壞腸道菌群的環境因素還有，污染的大氣、污染的水源、房屋裝修散發出來的汞和鉛等重金屬污染，以及甲醛，苯等污染物。這些因素都會導致腸道未老先衰。

二、飲食和生活習慣

不健康的生活方式，吸煙、喝酒，熬夜等。還有暴飲暴食、過多的肉食、過多的酸性食物、過多的快餐方便食品、過多的煎炸油膩食品、過多的冷飲食品等。

三、精神因素

精神壓力過大也可破壞腸道菌群平衡。如當宇航員從太空返回地球時,其體內絕大部分有益菌如乳酸菌已大部分損失。如果工作過于緊張繁忙，經常參加酒宴應酬，過重的精神壓力而產生焦慮、抑郁等情緒，導致神經內分泌系統功能失調，腸道生理功能紊亂，使腸道內微生態環境失去平衡，進而造成腸道老化。

四、創傷

手術、外傷、感染、腫瘤、化學物品及疾病時對腸道菌群也有影響，特別是危重癥患者，有時可喪失整個乳酸菌群 。

五、腫瘤治療

同位素、激素、放射治療和化療均可在治療疾病的同時降低機體免疫力，也破壞了腸道菌群的平衡。

六、濫用抗生素

長期大量使用廣譜抗生素后,可使大多數敏感菌和正常菌群被抑制或殺死，而耐藥菌則由于抗生素的選擇作用得以大量繁殖，結果導致菌群失調，出現腹瀉或便秘等癥狀。

七、便秘

對中老年人來說，由于腸道的張力和推動力逐漸減退，牙齒缺損，咀嚼食物咬不爛，加上吃的過于精細，運動量小等原因，致使胃腸道的消化、蠕動功能差，極易引起便秘，糞便在腸道停留時間過長，菌群生態發生改變，有害菌群增殖而影響健康。